１．
澄める青空　御陵の里に
高くはためく　われらが校旗
苦難をこえて
共に歩まん　自主の道
ああ　栄えある　わが学び舎よ
藤井寺第三中学校

２．
歴史を語り　ゆく大和川
うつすは明るさ　われらが健児
苦難をこえて
共にめざさん　独立独歩
ああ　栄えある　わが学び舎よ
藤井寺第三中学校